吕梁学院目前设有以下院系和专业：
1. 化学化工系
2. 矿业工程系
3. 建筑系
4. 计算机科学与技术系
5. 物理系
6. 生命科学系
7. 教育系
8. 体育系
9. 数学系
10. 经济管理系
11. 外语系
12. 中文系
13. 历史文化系
14. 艺术系
15. 思政部（系）
16. 交口分院
17. 继续教育学院
18. 语委办
19. 煤矿机械虚拟仿真实验教学中心
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